(第1-5集)

　　第一集：母女成仇（The Enemy Walks In）

　　西德妮向一名CIA精神病学家叙述了她最近的任务：在台北某地她被缚在一张椅子上，Khasinau介绍给她的“男人”，其实就是她的母亲Irina Derevko。Irina说自己本该一生下西德妮就把她弄死，并开枪打伤了她的肩膀，然后离去。西德妮在水阀上撞坏椅子得以逃生。

　　杰克救出了遭受毒打的威尔，西德妮与他会面讲述了经历，父女两人把他们的秘密和SD-6的真相告诉了受尽惊吓的威尔。杰克导演了一场戏，他告诉斯隆，是他向西德妮发出了“自由记者”信号，因为他不相信斯隆所说威尔的被绑架会让他们找到Khasinau。现在Khasinau的组织已被摧毁，杰克向斯隆表达忠诚，并说服他饶了威尔。迪克松也为自己的怀疑向西德妮道了歉。

　　斯隆派西德妮以Le Petite Rose的假名前往法国，在Khasinau的同党Jean Luc Rave办公室里安放电话窃听器，他还是法国国家集团的成员。西德妮把马歇尔的窃听器交给了特工威斯，他在上面动了手脚，可以延迟SD-6窃听到通话内容。

　　第二集：信任危机（Trust Me）

　　在Kendall的看管下，Irina被缚着送进了洛杉矶一处秘密手术室内。西德妮希望母亲为所作所为去死，但杰克怀疑Irina其实对西德妮真心实意。西德妮告诉沃恩她相信爱米莉是被斯隆所害。

　　已经成为12联盟正式成员的斯隆接受注射了一种神秘药剂。后来，他向西德妮承认，联盟知道Khasinau已经死了，并且相信Irina躲藏起来。他派西德妮去找一张电脑磁盘，里面包含有Irina用来敲诈的情报。碟盘存放在拉巴特酒店客房的一个保险箱中。西德妮的另一层任务就是要把碟盘交给拉巴特大使馆的秘密特工Richard Schmidt，他会伪造出一张假碟让西德妮交去SD-6，沃恩又说，西德妮也许可以问母亲碟片中的内容，但她拒绝了。

　　沃恩受到Kendall的压力，去和不合作的Irina谈话。沃恩提到西德妮的拉巴特任务时，她屈服了，说出西德妮在打开保险箱前必须先拉掉火警警铃。虽然不知她的话是真是假，沃恩还是迅速联络到了西德妮。后者化装成意大利游客，正准备打开保险箱，但她不愿听从指令，没有先拉警铃，结果拿取碟盘时警报响起，设法逃脱的她未能把碟片交给Schmid。

　　第三集：密码（Cipher）

　　西德妮得知，自己偷回的T波相机只是模型，亚洲空间代理处和他们的主顾Sark将制造出真正的相机。这种相机可以在斯里兰卡的一个地方穿透穿透固体屏障拍到100米远的地方。她的任务是给相机接入线路，这样SD-6就可以收到图像。中情局内，Kendall要西德妮和Irina谈话，因为Sark控制了她的组织，她一定知道他在找什么。同时，杰克告诉CIA精神专家，他不想让西德妮与Irina接近。

　　Irina告诉西德妮Sark在找寻Rambaldi设计的音乐盒，乐曲中蕴含着0点能源的数字方程式。西德妮断然拒绝与Irina谈论她的童年往事。杰克警告西德妮要当心Irina，但表示相信她的判断。

　　马歇尔给西德妮一个伪装成手提箱的水压撬，承受丧妻之痛的斯隆把爱米莉的种子箱交给了她。另外，沃恩给了她一块电路板用来装在相机上，他建议她找威尔帮忙，因为威尔一直与弗兰茜关在一起，可能会记得Sark启动音乐盒时的密码。

　　几人碰面后，威尔惊讶地得知沃恩这么年轻，并对他了解这么多他们的生活心生嫉妒。

　　第四集：致命血清（Dead Drop）

　　西德妮在水里挣扎着，从淹死的警卫身上摘下枪，隔着冰开了火，迪克松把她拽了出来。回到SD-6，她告诉斯隆，尽管Sark带走了音乐盒，但它已经遭到损坏。斯隆想知道Rambaldi为什么要把它放在冰里。

　　在CIA，Kendall拒绝了杰克送走Irina的要求。遇到西德妮后，杰克表示自己担心她们对话中流露出来的感情，他提醒说她内心想要一个母亲。

　　斯隆告诉杰克他接到了B&B打来的一个神秘电话，已派迪克松前去调查。SD-6从SarkFalkland岛上的保险库里拿到了音乐盒，他们发现一个名叫Klaus Richter的男子，因为接受了Sark注射的血清而病情严重。杰克讯问了Richter 后得知，他画了一张地图让Irina去寻找他藏在一个度假地的《圣经》，地图则藏在莫斯科军事图书馆里第一版《战争与和平》的书中。

　　为了阻止西德妮去见Irina，杰克给了她一张假地图，以便把SD-6引去Sunken森林。西德妮表示自己想从Irina那里得到足以令SD-6垮台的情报，从而结束自己的间谍生涯。

　　第五集：秘密武器（The Indicator）

　　西德妮在CIA陪审团面前作证，称杰克把她从Irina设下的陷阱中救了出来，在空无一人的房间里，她找到了Irina的耳环。

　　维也纳，SD-6在奥地利的联络人Neils Haber被Triad杀害，这是一个毒品和卖淫组织，现在开始从事贩卖军火。Haber称，Triad正在开发16个“下一代”武器，藏在布达佩斯的一个防弹工事中。西德妮奉SD-6之命拍下武器的照片，并弄到说明。沃恩不赞成再派杰克执行双重任务，他认为在马达加斯加的任务中杰克帮了Irina的忙，这让西德妮十分气愤。

　　弗兰茜的餐馆开张，杰克给西德妮布置了双重使命，侵入电脑为CIA偷取文件，同时为SD-6下载假文件。他告诉西德妮，Irina因为违背了与CIA的协议，面临死亡的惩处。一名美国公民Manolo Souza因为运送爆炸物在马达加斯加被捕，沃恩与他谈话，Souza告诉他自己为杰克工作，这证实了沃恩的怀疑。
布达佩思，头戴金色假发，戴着太阳镜的西德妮，混进了治官大楼，成功地下载了文件。但是迪克松领她进入防弹工事后，她才发现一个男人正在教授一群孩子如何装配枪枝，原来秘密武器就是这些孩子。

(第6-10集)

　　第六集：救母（Salvation）

　　Irina受审的日子临近，斯隆告知西德妮，Richter感染的是Sark研制的类似埃博拉的病毒。Sark正在日内瓦的私人医院，研究三位受感染病人的病情。杰克和西德妮要乔装成富有的南方病人和女儿，混进医院了解他的研究内容。

　　杰克向西德妮解释说自己不想让她成为间谍，用圣诞方案对她进行测试只是为了让她在危险环境中能够坚强起来，但是斯隆比他快了一步，西德妮对此将信将疑。

　　Irina承认有罪，被判处三天内执行死刑，西德妮大为愤慨，为了取消对Irina的处决，她给Devlin写信，声称杰克欺骗了CIA。沃恩向Devlin解释说，他发现了苏联80年代起开始了与美国一样的标准测试，他认为是Irina从杰克那里偷到研究，在美国可能有苏联的恐怖小组，Devlin半信半疑。沃恩雇了威尔作为自由记者调查此事。

　　在飞往日内瓦的飞机上，知道西德妮写信的杰克说，Irina认罪只是博取她同情的手段。西德妮说生下自己是杰克最大的错误，代表他容易上当。父女俩用假名来到医院，在手术台上杰克制住医生并下载了调查文件，西德妮从一名垂死病人的身上抽取血样，那人说出了Irina的名字。

　　两人引发爆炸趁乱逃上屋顶的直升机，杰克解释是Irina命令Sark让她手下间谍受到感染，用他们做试验。

　　第七集：解药（The Counteragent）

　　沃恩包起了受伤的手指，来到Irina的牢室，她感谢他为马达加斯加行动作证。沃恩承认自己病了，他问Irina拿真人做红球试验后，Khasinau有什么发现，Irina反问他是否爱西德妮，沃恩回答说，如果她提供帮助，他会让西德妮知道。

　　威尔告诉西德妮1982年的标准测试材料不在公共纪录中，她解释了“圣诞计划”并说沃恩认为，俄国情报组织仍然在用其招募美国特工。

　　CIA，西德妮听说沃恩病了，她问Irina是否有解药，得到回答说爱莎尼亚的Paldiski有一个前苏联的核潜水艇水兵训练基地，但是解药具有遗传特效性，所以西德妮必须从沃恩的血液中造出解药。沃恩入院，医生说他只能活三天，西德妮抽了他的血样，和他握手告别，出来的时候碰见了沃恩的女朋友爱丽斯(Alice)。

　　斯隆向杰克承认，他对自己在12联盟内的地位没有安全感，而且必须前往东京向Kristof坦白爱米莉的事。为了找出Derevko的手术基地，他对Richter百般拷问。

　　第八集：通道：上（Passage Part I）

　　西德妮私下告诉Sark，如果他胆敢多嘴，自己一定有仇必报。Sark向她保证说为了他自身的安全也一定会保持沉默。西德妮仍不放心，问Irina自己是否要告诉Sark双重间谍的身份，Irina要她千万不可以。

　　SD-6，斯隆向上级报告Sark已经投诚，并以情报为交换条件，求得免罚，他保证Sark不会违反约定，Sark自己也说背叛他们自己得不到好处。

　　斯隆给西德妮和迪克松布置了新任务：去购买乌兹别克军队使用的密码。邻国塔吉克斯坦的极端分子武装准备利用密码发动恐怖袭击，SD-6想研究他们的行动。从西德妮嘴里得知这个消息的Irina，坚持要求假释48小时但拒绝透露去做什么，因此没有得到许可。

　　Sark告诉斯隆，西德妮怀疑他并不是真正自首，鉴于杰克与西德妮的父女关系，他们决定不让他知道密码的真正用途。Sark离去，斯隆接到神秘人的电话，要他交出SD-6所有投资帐号，否则就要他为妻子爱米莉的死负责，斯隆不为所动，与之针锋相对。

　　西德妮和迪克松在乌兹别克斯坦拿到了装在箱子里的密码，但是如果没有箱子主人的指纹确认，开启时箱子就会爆炸，而箱子的主人--一名乌兹别克士兵已经被暗杀。迪克松化装成乌兹别克士兵，把西德妮的“尸体”送进了太平间。西德妮找到了那名士兵并获得他的指纹，然后杀出重围与迪克松会合。

　　第九集：通道：下（"Passage Part 2）

　　CIA总部，沃恩听说巴基斯坦叛乱武装（PRF）要伏击西德妮、杰克和Irina，派遣救援小组可能激怒巴基斯坦当局。更糟的是，沃恩收到备忘录中说次日核弹头将被激活。他把这个消息通知了西德妮，她开玩笑说别的家庭去打高尔夫，他们一家却去找核弹头。三个人化装成巴基斯坦人，前往PRF基地。Irina建议最容易的办法就是从雷区旁边的一处下水管通进去，杰克将信将疑，但他们别无选择。

　　SD-6，Sark告诉斯隆他和PRF的头子Gerard Cuvee谈过，等行动结束后他会把“结果”传入服务器。斯隆又接到另一个有关他妻子的神秘电话，那人要求他24小时内汇出1亿，否则下个电话将会打给12联盟。

　　靠近PRF设施的地方，西德妮一行再次受到袭击。杰克给了Irina一支枪，三人联手打退了敌人。杰克掉入地雷陷阱，稍有动静就会触发爆炸。在Irina指导下，西德妮拆除了炸弹的引信。

　　同时，沃恩发现印度已经得知了核武器的事，准备在24小时内向巴基斯坦叛乱武装发动空袭。

　　第十集：诱导（The Abduction）
西德妮告诉威尔，如果他接受心理评估测试，Devlin就会支持他继续调查。弗兰茜对两人神秘的样子感到好奇。Irina向西德妮解释自己为克格勃工作的原因，并为抛弃女儿深深悔恨，母女俩拥抱在一起，但被警卫拉开。

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