由于《三国征战》移植于世嘉经典街机游戏《三国志大战》，因此，在街机游戏厅玩过《三国志大战》的部分玩家，操作《三国征战》游戏时就是轻车熟路。不过，对于很多第一次接触此类游戏的玩家来说，全新的游戏模式确实让人有些不知所措，以此，游戏官方为玩家提供新手操作指南，希望给玩家游戏带来帮助。
内政操作指南：（选将和布阵）
一、 玩家登录游戏后，就会看到中华第一城的游戏界面，在界面右上方有对应的系统设置。玩家可以点击“内政”字样，或者点击文字对应的界面部分。
二、 进入内政大厅后，分别打开界面右边卷轴盒里的套牌卷轴和武将卷轴，选择出征武将时，只要把鼠标移动到卷轴盒上，就可以进入选将界面。
三、 用鼠标左键拖动点将页面上方卷轴里的武将至卷轴外，下方的套牌卷轴出现所选武将后，松开鼠标就完成了该名武将的选定。（选定其他武将用同样的方式）
四、 完成全部点将操作后，点击保存，然后打开“请下令”中的“命名”，就可以对保存的武将出征套牌进行命名。
【注：玩家在选择武将时须注意所选武将所属的势力，所属同一势力的玩家组合起来，出征阵营的士气才能达到最高，以利于武将计策的发挥。此外，玩家还要注意所选武将俸禄总值不能军饷总值，即8两。】
五、 在内政界面中点击左边的棋盘，就到了排兵布阵界面。系统默认打开第一套套牌卷轴后，玩家用右键选择棋子直接拖动到需要摆放的位置，也可以先用左键选择，在需要摆放的位置点击右键确定。
六、 用左键选中棋子左右拖动或转动滚轮调整角度后，点击保存即可。
七、 至此，选将和布阵的内政操作就完成了。
出征操作指南：
一、 内政操作完成后，从“请下令”中返回至中华第一城，然后进入出征系统。
二、 选择服务器进入战场，红色图标代表玩家正在对战的战场，绿色图标代表空城，黄色图标代表已有玩家占领，等待另一位玩家进行挑战的战场。
三、 点击大地图上的黄色图标，就可以直接进入战场与城主对战。
四、 玩家要开辟战场的话就需要点击选择绿色图标，然后进入战场，再点击石碑，输入战场资料，确定后就进入出征页面等待其他玩家进入。（如果允许其他玩家与自己对战就不要设置密码）
五、 在等待其他玩家对战的页面，玩家可以在“请下令中”选择自己设置的其他套牌和兵法。当来进行挑战的玩家准备完毕后，点击石碑就可以出阵。
六、 进入战前配置页面后，玩家可以根据具体战场地形对武将位置进行调整，然后点击开战就可以与玩家进行对战了。
内政和出征的入门操作基本上就是这些，不过，玩家在出征后的对战中，必须运用多种技巧和方式，利用各兵种的相克关系，以智取胜，这就需要玩家多多摸索和相互探讨了。
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